按照撤退部署，除第36师掩护司令部和直属部队从下关渡江以外，其他部队都要从正面突围，但唐担心属于中央军嫡系在突围中损失太大，又口头命令第87师、第88师、第74军和教导总队“如不能全部突围，有轮渡时可过江”.
都到这个时候了，上层还在打着自己的小算盘，唐还要保蒋的中央军嫡系.
结果就是造成了更大的混乱.
会议结束后，只有属于粤系的第66军和第83军在军长叶肇和邓龙光带领下向正面突围，在付出巨大代价后成功突破日军包围，第159师代师长罗策群战死.
其他部队长官大多数没有向下完整地传达撤退部署，就各自抛下部队前往江边乘事先控制的船只逃离.
晚上，发誓要与南京共存亡的唐坐乘事先保留的船只逃了.
长官们留下固守的部队逃了，这些部队听说长官退往下关，以为江边已经做好了撤退准备，于是放弃阵地涌向下关一带.
然后因为负责封锁挹江门的第36师没有接到允许部队撤退的命令，和从城内退往下关的部队发生冲突，很多人被打死或踩死.
逃到下关的中国守军已经失去建制，成为混乱的散兵，其中有些人自己扎筏过江，很多人淹死、或是被赶到的日军射杀在江中.
大部分未能过江或者突围的中国士兵流散在南京街头，不少人放弃武器，换上便装躲入南京安全区.
然后大屠杀开始了.
当然，在南京保卫战中有浴血奋战，以身报国的热血军人，但更多的还是被抛弃而没有了斗志，如同无头苍蝇一般的国军士兵和只顾自己不顾部下的所谓长官.
乔峰其实本来是只想在电影里展现国军上层的只顾保全自身的蝇营狗苟，但后来想到如果只是这样的话，未免太对不起那些在战争中浴血奋战的士兵还有如同战死的第159师代师长罗策群这样的爱国将军了，也未免会让观众觉得看的太丧，太负能量了.
所以，最后和斯皮尔伯格讨论之后还是决定在用一定的时间呈现真实的南京大屠杀之前的国军的守城以及仓皇撤退情景的同时给观众一点正能量，一点希望.
和原版金陵十三钗差不多，加入一支抵抗曰军的教导总队的士兵.
之所以要加入教导总队，而不是别的部队，是因为教导总队的装备是国军最精良的，人员素质也是最好的.
在此期间，确实是浴血奋战了的.
从淞沪会战上，教导总队就伤亡不小，回到南京，在保卫战中也是伤亡惨重，教导总队第二团守军营长阵亡五人，几乎伤亡殆尽.
但是起总队长也和唐以及其他军官一样，在撤退的时候自己先跑了.
虽然桂总队长是坚持到了最后一天，但不得不说，国军有些当官的，打仗时候或许有血气，可在撤退的时候绝逼是跑的最快的.
所以，乔峰并不会在电影里安排让这些士兵护送学生到教堂，因为撤退途中他们顾不上管别人的.
他们是在撤退中遭遇了曰本军队，一边打一边退，在付出了巨大牺牲之后终于摆脱了日军，活下来的几名伤员跑散了，其中两个逃到了教堂.
而教堂里也并不是只有逃回来的学生还有逃难的秦淮姑娘以及士兵.
因为在南京城破之后，没有一个能作为容身之所的地方，一个外国人的教堂里边会只有单纯的这么几个群体存在的.
除了逃回来的学生，秦淮姑娘，士兵外里边还有几十个老弱妇孺以及一位平日教导学生的女传教士明妮.
这也是和原版金陵十三钗最大的不同，乔峰想要的十三钗并不都是秦淮河上的姑娘.
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