因此杨素上前趁机向杨坚进言：“废人担任禁卫，本就无此先例。况太子已有兵变之事，难道日后要同样防着废长宁王再次兵谏吗？希望圣人对这件事应象蝮蛇螫手一样，不应再留此意。”
杨坚想了想，杨俨身份特殊，确实不适合留在自己身边，遂罢了此心思，将东宫众人全都跟杨勇一起囚禁。
确定了杨勇的处置，太子的党羽便好处理了。
十二月三日，杨坚又下诏书说：“太子的作乱全部都是被东宫旧臣蛊惑的，罪责皆在这些人身上。太子左庶子唐令则、太子家令邹文腾、太子左卫率司马夏侯福、前吏部侍郎萧子宝、通直散骑侍郎元衡、游骑尉沈福宝、典膳监元淹、前主玺下士何竦、太子右内率军副率于让等人因蛊惑太子，谋反叛乱，直接处死，包括已经在叛乱之夜死去的太子左卫率元颍、太子左监门率宗胜、率更令晋文建、太子左卫率大都督龙风等人，他们的妻妾子孙都没入官府为奴。
凡参与当日太子作乱的太子左卫率、太子左右内率、太子左右监门率从九品以上官员全部处死，妻妾子孙没入官府为奴。
副将作大匠高龙叉坐太子党，被判罪令其自尽。
车骑将军榆林人阎毗、东郡公崔君绰、瀛州术士章仇太翼等人坐太子党，特赦免死，各受杖刑一百，本人及其妻子儿女，家产田宅都没入官府······”
杨坚命人在广阳门外召集百官宣读诏书，宣布将上述判死刑的人处死。
杨坚又安排以杨素为首，元胄、赵绰、杨约等人一起审理太子一党。
此案先后坐太子党被处理的不下百人。至于整个太子左卫率、太子左右内率、太子左右监门率，原本是世家大族子弟镀金的好地方，虽然现在也没几个人了，但都快要被杀光了。
除此之外，当日跟随杨勇一同作乱的家族也不少，包括原左卫大将军元旻府上等大大小小数十家，都被抄家问罪，监狱里是人满为患，都装不下人了。
武德殿毕竟是内廷宫殿，不适合安置杨勇一大家子。因此杨坚又把杨勇迁到内史省关押，给他五品官员的俸禄，聊以度日。
同时杨坚又赐给杨素财物三千段，赐给元胃、杨约财物共一千段，作为审讯杨勇的功劳的奖赏。
隔日，杨坚又下令杨素叔父冀州刺史正平郡公杨文思迁民部侍郎，熊州（今河南宜阳县西）刺史上明郡公杨文纪升为宗正卿兼给事黄门侍郎，行礼部尚书事。
一时之间，杨素权势盈天，成为举足轻重的重臣。
而杨广看到圣人如砍瓜切菜一般处置太子党，放下了心中对太子存活的不快。现在杨勇羽翼全失，他倒也不认为太子能翻起什么浪了。
唯有裴矩感到一丝不妥，圣人怎么能把杨勇放置在内史省。内史省在大兴殿一侧，虽然能看得紧，但也离圣人近，容易被有心人利用啊。