巨鹿之战中秦军被项羽击败秦军退却。章邯退至棘原驻扎项羽驻扎在漳水南岸两军相持没有交战。
投奔楚国
秦二世三年（公元前207年）冬天赵高做了丞相朝政专权谗害忠良。因秦军的退却二世派人责让章邯。章邯恐惧派长史司马欣去请示。司马欣到了咸阳留在司马门3天赵高不接见有不信任之意。长史司马欣心里害怕急忙逃回军中。他怕有人来追杀没有敢走原路。赵高果然派人追赶他没有追上。司马欣到了军中向章邯报告说：“赵高居中用事下面的人不可能有所作为。如今仗能打赢赵高必定嫉妒我们的功劳；仗打不赢免不了被处死。希望将军深思熟虑。”陈余也送给章邯一封信说：“白起为秦将向南攻拔鄢、郢向北坑杀马服攻城略地不可胜数而最后竟然赐死。蒙恬为秦将北逐匈奴开辟榆中几千里的地域最终竟然斩于阳周。为什么呢？功劳太多秦不能按功行封因此罗织罪名用国法杀死他们。现在将军为秦将3年了所损失的士卒以10万计而诸侯军同时并起越来越多。那个赵高一向谄谀为时己久眼下形势危急也怕二世杀他所以打算用法杀死将军借以推卸责任另外派人替代将军以此来摆脱祸患。将军在外时日已久朝廷中很多人与你有隔阂有功也是被杀无功也是被杀。况且天要亡秦无论是愚笨的人还是聪明的人全都知道。如今将军在内不能直言规谏在外为即将灭亡的国家的将领孓然孤立而想长期存在岂不可哀！将军何不倒戈与各路诸侯联合签订和约共同攻秦割地为王南向而坐称孤道寡；这同自己伏砧受戮妻子被杀哪个比较好一些呢？”章邯犹豫不决暗中派军候始成到项羽营中想要签署和约。和约没有商妥项羽让蒲将军昼夜领兵渡过三户津扎营漳水南岸与秦军交战又一次打败了秦军。项羽率领全军士卒在污水上攻击秦军把秦军打得大败。
章邯派人去见项羽打算订立和约。项羽召集军吏商量说：“军中粮少想允许他签订和约。”军吏都说：“好。”项羽就与章邯订期在桓水南岸殷墟相见。已经缔结了盟约章邯见到项羽涕泪交下向项羽诉说赵高的种种行径。项羽就立章邯为雍王安置在楚军营中使长史司马欣为上将军率领秦军为先行部队。汉元年十一月担心秦军突然暴动项羽不能保证能够制服他们。二十万秦军降卒被项羽坑杀于新安（河南渑池城东）南章邯由此背上了“秦奸”的骂名。
赵高杀死了二世胡亥立三世子婴做皇帝。子婴做了46天秦王楚军打垮了秦军进人武关。子婴就用丝带系着脖子白马素车捧着天子的印玺和符节在轵道旁投降。秦朝最后灭亡了过了5年后汉朝才统一了全国。
消灭秦国项羽为诸侯联军的领袖杀死了子婴和秦公子的宗族。屠毁咸阳焚烧宫室俘虏了秦国子弟和妇女把珍宝财物搜刮在一起诸侯们共同瓜分了。项羽为西楚霸王负责分封天下诸侯王消灭了秦国以后把它的土地分为3部分封立3个王名叫雍王、塞王、翟王号称三秦。封章邯为雍王称王于咸阳以西建都废丘(今陕西省兴平县东南)。长史司马欣从前做栎阳狱掾曾对项梁有过恩德；都尉董翳最初劝说章邯降楚。所以封司马欣为塞王；称王于咸阳以东到黄河一带建都栎阳；封董翳为翟王称王于上郡建都高奴。
汉王元年（公元前206年）八月汉王刘邦用韩信的计策从古道回军袭击雍王章邯。章邯在陈仓迎击汉军雍王兵败退保废丘。汉王随即平定了雍地向东到达咸阳率军围困雍王于废丘。
刘邦久攻废丘不下至汉王二年（公元前205年）六月被刘邦大将韩信用计水淹城池而城破章邯遂拔剑自刎。
章邯的家人：
章邯有二弟一谓章平章愍次子；一谓章豨章愍三子。章平亦为秦末将军。随兄章邯降楚后仕楚为上卿领兵守武关。刘邦围攻废丘章邯命其弟章平支援章平被韩信大败而被俘。后迁居豫章洪州(今江西省南昌市)。
章平生一子章直汉朝巴东将军。章直生一子章宜世居豫章洪州。